بعد نياحة البابا بطرس الخامس تم اختيار الراهب غبريال من دير شهران بطريركًا وتمت رسامته في 5 سبتمبر سنة 1348 م. في أيامه صودرت أملاك الكنيسة والأديرة القبطية وكانت تبلغ 25 ألف فدان كلها موقوفة للكنائس والأديرة. في أيامه حدث فناء عظيم في القرى أتى بالخراب على معظم القرى المصرية. بعد جهاد عظيم وصبر تنيَّح في 31 يناير 1363 م. وقد قضى على الكرسي 14 سنة و4 أشهر و26 يومًا. صلاته تكون معنا آمين.